文献検索

Valyu のセマンティック検索 API を活用した自然言語クエリにより、主要な科学文献データベース (PubMed、arXiv、bioRxiv、medRxiv) 全体を同時に検索できます。

このスキルが強力な理由

• API パラメータ解析不要: 自然言語クエリを直接渡すだけで済みます。複雑な検索パラメータを構築する必要がありません
• セマンティック検索: キーワードマッチングではなく、クエリの意味を理解します
• フルテキストアクセス: 要約だけでなく、記事の完全な内容を返します
• 画像リンク: 論文の図表や画像を含みます
• 包括的なカバレッジ: PubMed、arXiv、bioRxiv、medRxiv を同時に検索します
• 統一された結果: すべてのソースからの結果を 1 つのクエリで取得します

必要な環境

1. Node.js 18 以上 (組み込み fetch を使用)
2. https://platform.valyu.ai から取得した Valyu API キー (10ドル相当の無料クレジット)

重要: スクリプトパス解決

このドキュメント内の scripts/search コマンドは、このスキルのインストールディレクトリを基準とした相対パスです。

コマンド実行前に、以下を使ってスクリプトを検索してください:

LITERATURE_SCRIPT=$(find ~/.claude/plugins/cache -name "search" -path "*/literature-search/*/scripts/*" -type f 2>/dev/null | head -1)

すべてのコマンドでフルパスを使用してください:

$LITERATURE_SCRIPT "CRISPR gene editing advances" 15

API キー設定フロー

検索実行時に "setup_required": true を受け取った場合、以下のフローに従ってください:

1. ユーザーに API キーを要求: 「科学文献を検索するには、Valyu API キーが必要です。https://platform.valyu.ai で無料取得できます (10ドル相当のクレジット)」

2. ユーザーがキーを提供したら、以下を実行:

   scripts/search setup <api-key>
   

3. 元の検索を再試行します。

このスキルを使用する場合

• すべての分野にわたる包括的な文献レビュー
• トピックに関連するすべての研究を検索
• クロスドメインの科学的発見
• 生物医学、物理学、プレプリント文献の統合
• 分野横断的な新興研究

出力フォーマット

{
  "success": true,
  "type": "literature_search",
  "query": "CRISPR gene editing advances",
  "result_count": 15,
  "results": [
    {
      "title": "Article Title",
      "url": "https://...",
      "content": "Full article text with figures...",
      "source": "pubmed|arxiv|biorxiv|medrxiv",
      "relevance_score": 0.95,
      "images": ["https://example.com/figure1.jpg"]
    }
  ],
  "cost": 0.025
}

結果の処理

jq を使用する場合

# 記事タイトルを取得
scripts/search "query" 20 | jq -r '.results[].title'

# URL を取得
scripts/search "query" 20 | jq -r '.results[].url'

# 完全な内容を抽出
scripts/search "query" 20 | jq -r '.results[].content'

# ソースでフィルタリング
scripts/search "query" 20 | jq -r '.results[] | select(.source == "arxiv") | .title'

一般的なユースケース

包括的な文献レビュー

# すべてのソースを検索して徹底的なレビューを実施
scripts/search "mechanisms of cellular senescence" 100

クロスディシプリナリ研究

# 複数の分野にまたがる論文を検索
scripts/search "quantum computing applications in drug discovery" 50

最新の展開

# 最新のプレプリントおよび出版物を取得
scripts/search "foundation models for protein folding" 30

医学研究

# 生物医学文献を包括的に検索
scripts/search "immunotherapy checkpoint inhibitors resistance" 40

エラー処理

すべてのコマンドは success フィールド付きの JSON を返します:

{
  "success": false,
  "error": "Error message"
}

終了コード:

• 0 - 成功
• 1 - エラー (詳細は JSON を確認)

API エンドポイント

• ベース URL: https://api.valyu.ai/v1
• エンドポイント: /search
• 認証: X-API-Key ヘッダー

アーキテクチャ

scripts/
├── search          # Bash ラッパー
└── search.mjs      # Node.js CLI

Node.js 組み込みの fetch() を使用した直接 API 呼び出し。外部依存関係はありません。

プロジェクトへの追加

AI プロジェクトを構築していて、Literature Search をアプリケーションに直接統合したい場合は、Valyu SDK を使用してください:

Python インテグレーション

from valyu import Valyu

client = Valyu(api_key="your-api-key")

response = client.search(
    query="your search query here",
    included_sources=["valyu/valyu-pubmed", "valyu/valyu-arxiv", "valyu/valyu-biorxiv", "valyu/valyu-medrxiv"],
    max_results=20
)

for result in response["results"]:
    print(f"Title: {result['title']}")
    print(f"URL: {result['url']}")
    print(f"Content: {result['content'][:500]}...")

TypeScript インテグレーション

import { Valyu } from "valyu-js";

const client = new Valyu("your-api-key");

const response = await client.search({
  query: "your search query here",
  includedSources: ["valyu/valyu-pubmed", "valyu/valyu-arxiv", "valyu/valyu-biorxiv", "valyu/valyu-medrxiv"],
  maxResults: 20
});

response.results.forEach((result) => {
  console.log(`Title: ${result.title}`);
  console.log(`URL: ${result.url}`);
  console.log(`Content: ${result.content.substring(0, 500)}...`);
});

完全なインテグレーション例および SDK リファレンスについては Valyu ドキュメント を参照してください。