SIMO マルチオミクス統合エージェント

SIMO マルチオミクス統合エージェントは、確率的アラインメントによるマルチオミクスデータセットの空間統合を実行します。以前のツールは転写産物学に限定されていましたが、SIMOは空間転写産物学とシングルセル RNA-seq を統合し、クロマチンアクセシビリティ、DNA メチル化、およびプロテオミクスデータまで拡張します。

このスキルを使用する場合

• 空間転写産物学とシングルセルマルチオミクスデータを統合する場合
• 空間的文脈を含む包括的な組織アトラスを構築する場合
• エピゲノミック状態(ATAC-seq、メチル化)を空間座標にマッピングする場合
• 組織アーキテクチャ内のマルチモーダル細胞表現型を分析する場合
• 複数のモダリティを組み合わせた空間デコンボリューションを実行する場合

コア機能

1. 空間-scRNA 統合: シングルセル RNA-seq を確率的に空間座標にアラインメントします。

2. クロマチンアクセシビリティマッピング: scATAC-seq プロファイルを空間組織位置に投影します。

3. DNA メチル化空間マッピング: シングルセルメチル化データを空間的文脈と統合します。

4. マルチモーダル融合: 転写産物学、エピゲノミック、およびプロテ

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