Matchms

概要

Matchmsは、質量分析法データの処理および分析用のオープンソースPythonライブラリです。様々なフォーマットからスペクトラをインポートし、メタデータを標準化し、ピークをフィルタリングし、スペクトラルの類似性を計算し、再現性のある分析ワークフローを構築します。

コア機能

1. 質量分析法データのインポートおよびエクスポート

複数のファイル形式からスペクトラをロードし、処理済みデータをエクスポートします：

from matchms.importing import load_from_mgf, load_from_mzml, load_from_msp, load_from_json
from matchms.exporting import save_as_mgf, save_as_msp, save_as_json

# Import spectra
spectra = list(load_from_mgf("spectra.mgf"))
spectra = list(load_from_mzml("data.mzML"))
spectra = list(load_from_msp("library.msp"))

# Export processed spectra
save_as_mgf(spe

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