matchms
マススペクトロメトリー分析を実施できます。mzML/MGF/MSP形式のデータを処理し、スペクトル類似度（コサイン、修正コサイン）の計算、メタデータの統一化、化合物識別を行います。メタボロミクスおよびMS（マススペクトロメトリー）データ処理に対応しています。
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Mass spectrometry analysis. Process mzML/MGF/MSP, spectral similarity (cosine, modified cosine), metadata harmonization, compound ID, for metabolomics and MS data processing.
SKILL.md 本文
Matchms
概要
Matchmsは、質量分析法データの処理および分析用のオープンソースPythonライブラリです。様々なフォーマットからスペクトラをインポートし、メタデータを標準化し、ピークをフィルタリングし、スペクトラルの類似性を計算し、再現性のある分析ワークフローを構築します。
コア機能
1. 質量分析法データのインポートおよびエクスポート
複数のファイル形式からスペクトラをロードし、処理済みデータをエクスポートします：
from matchms.importing import load_from_mgf, load_from_mzml, load_from_msp, load_from_json
from matchms.exporting import save_as_mgf, save_as_msp, save_as_json
# Import spectra
spectra = list(load_from_mgf("spectra.mgf"))
spectra = list(load_from_mzml("data.mzML"))
spectra = list(load_from_msp("library.msp"))
# Export processed spectra
save_as_mgf(spe
...
詳細情報
- 作者
- sanand0
- ライセンス
- unknown
- 最終更新
- 2025/11/21
Source: https://github.com/sanand0/scientific-research / ライセンス: unknown
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