gMCPLiteを使用したグラフィカルMCP(レガシー)

新規プロジェクトの場合は、より簡潔なAPIを備えたgraphicalMCPパッケージを推奨します。

APIリファレンス

• 完全な関数ドキュメント: references/llms.txt(ローカルmanページから生成)
• ワークフローパターン: references/code_patterns.md

主要関数

グラフの作成

• matrix2graph() - 遷移行列からgraphMCPオブジェクトを作成
• graphMCPクラス - コアとなるグラフ表現(仮説、ウェイト、遷移)
• joinGraphs() - 複数のグラフを結合
• subgraph() - サブグラフを抽出

検定

• gMCP() - グラフィカルMCP検定手順
• gMCP.extended() - パラメトリック検定を伴う拡張検定
• graphTest() - グラフ上で仮説を検定

可視化

• hGraph() - 多重性グラフの可視化を作成(ggplot2ベース)
• placeNodes() - グラフレイアウト用のノード位置を計算

検定関数

• bonferroni.test() - ボンフェローニ検定
• `bonf

...