汎用データ・分析⭐ リポ 7品質スコア 74/100
functional-screen-analysis
ENCODEの機能ゲノミクススクリーンを分析できます。CRISPR スクリーン、MPRA（大規模並列レポーターアッセイ）、STARR-seq などに対応しています。ENCODE からスクリーンデータを検索し、結果を処理して機能領域を特定し、エピゲノム注釈と統合します。
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Analyze ENCODE functional genomics screens including CRISPR screens, MPRA (Massively Parallel Reporter Assays), and STARR-seq. Find screen data in ENCODE, process results, identify functional elements, and integrate with epigenomic annotations.
SKILL.md 本文
注意: このスキルのライセンスは AGPL-3.0 です。本サイトでは本文プレビューのみを表示しています。利用前に GitHub の原本でライセンス条件をご確認ください。
Analyze ENCODE Functional Genomics Screens
When to Use
- User wants to find or analyze CRISPR screen, MPRA, or STARR-seq data from ENCODE
- User asks about "functional screens", "CRISPR perturbation", "reporter assay", or "enhancer validation"
- User needs to identify functionally validated regulatory elements from screen results
- User wants to integrate screen results with epigenomic annotations (ChIP-seq, ATAC-seq peaks)
- Example queries: "find CRISPR screen data in ENCODE", "analyze MPRA results for enhancer activity", "which regulatory elements have functional validation?"
Discov
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詳細情報
- 作者
- ammawla
- ライセンス
- AGPL-3.0
- 最終更新
- 2026/5/8
Source: https://github.com/ammawla/encode-toolkit / ライセンス: AGPL-3.0